인도 엠폭스 사례, Ib·IIb 재조합 변이의 가장 이른 감염 사례로 확인

9월 감염 사례가 드러낸 더 큰 감시 공백

아라비아반도에서 일하던 중 2025년 9월 1일 엠폭스 증상이 나타난 남성이 엠폭스 계통인 클레이드 Ib와 IIb의 유전 물질을 모두 포함한 재조합 바이러스의 가장 이른 감염 사례로 확인됐다. 이 남성의 감염은 9월 11일 인도에서 확진됐지만, 관련 바이러스가 영국에서 확인돼 국제 데이터베이스에 등록된 뒤에야 이례적인 유전적 구성이 밝혀졌다.

세계보건기구(WHO)는 인도와 영국에서 확인된 바이러스의 유전적 유사도가 99.9%를 넘는다고 밝혔다. 두 환자 모두 중증으로 악화하지 않고 회복했으며, 양국에서 접촉자 추적 결과 2차 감염 사례는 발견되지 않았다. 그러나 두 환자의 여행 이력은 해당 변이의 전파가 이 두 건의 확인 사례에만 국한되지 않을 가능성을 시사한다.

WHO는 엠폭스 발병 공지에서 재조합 변이의 전파가 이미 WHO 3개 지역에 걸친 최소 4개국에서 이뤄진 것으로 평가했다. 확진 환자 두 명은 아시아의 서로 다른 지역에서 이동한 이력이 있어, 서로 밀접한 관련이 있는 감염 사례는 국제 감시가 필요하다는 신호가 됐다.

인도 의학연구위원회(ICMR) 산하 푸네 국립바이러스연구소 연구진이 케랄라주와 푸두체리의 임상 협력기관과 함께 진행한 인도 사례 조사는 학술지 네이처 마이크로바이올로지에 게재됐다. 연구진은 바이러스 유전체의 거의 전체를 확보했고 환자 검체에서 살아 있는 바이러스를 배양했다.

당면한 과제는 실질적인 문제다. 일반 검사는 엠폭스를 확인했지만, 유전적 계통을 판별하기 위한 검사에서는 인도와 영국의 초기 분류 결과가 서로 달랐다. 바이러스 유전체 분석을 통해 두 사례의 연관성이 드러났다.

인도 사례의 재분류 과정

인도 환자는 아라비아반도 국가에 거주하던 해외 노동자였다. 현지에서 증상이 나타난 뒤 인도로 돌아왔으며, PCR 검사에서 원숭이두창 바이러스 감염이 확인됐다. PCR 검사는 바이러스 DNA의 특정 부분을 검출하며, 엠폭스 진단에 쓰이는 주요 실험실 검사법이다.

9월 15일 추가 검사에서는 환자의 바이러스가 처음에 클레이드 II로 분류됐다. 유전자 서열에 대한 초기 분석에서도 2022년 시작된 세계적 유행의 원인 계통인 클레이드 IIb일 가능성이 제기됐다.

전환점은 2025년 12월 16일, 영국에서 확인된 재조합 변이가 글로벌 Nextclade 데이터베이스에 추가되면서 찾아왔다. 재평가 결과 인도 바이러스도 같은 재조합 변이에 속하는 것으로 확인됐다. 인도는 2026년 1월 13일 WHO에 이를 통보했다.

이 일련의 과정은 인도에서 더 이른 감염 사례가 있었는데도 영국이 먼저 해당 변이를 보고한 이유를 보여준다.

• 2025년 9월 1일: 인도 환자가 해외 체류 중 증상을 보였다.
• 9월 11일: 인도에서 PCR 검사로 엠폭스가 확진됐다.
• 9월 15일: 계통 구분 검사에서 처음에 클레이드 II로 판정됐다.
• 9월 29일: 환자는 의학적 합병증 없이 회복한 뒤 검사에서 음성 판정을 받았다.
• 10월: 영국 환자가 아시아·태평양 지역 국가에서 돌아왔다.
• 12월: 영국이 재조합 변이를 보고했고, 해당 변이는 12월 16일 Nextclade에 등록됐다.
• 2026년 1월 13일: 인도가 후향적 분석으로 확인한 재조합 감염 사례를 WHO에 통보했다.

WHO에 따르면 인도 환자의 증상 발현은 영국 환자보다 두 달 이상 빨랐다. 이 재조합 변이의 확인은 두 환자의 증상만으로 이뤄진 것이 아니라 국경을 넘어 유전 정보를 연결한 결과였다.

재조합 바이러스란

원숭이두창 바이러스(MPXV)에는 클레이드 I과 클레이드 II라는 두 가지 주요 유전 계통이 있다. 각각 Ia, Ib, IIa, IIb로 나뉜다. 클레이드 Ib는 2023년 콩고민주공화국 남키부주에서 출현한 뒤 국제적으로 확산됐다. 클레이드 IIb는 2022년 시작된 세계적 유행을 일으켰다.

서로 관련된 두 바이러스가 같은 세포를 감염시키고 복제 과정에서 유전 물질을 교환하면 재조합이 일어날 수 있다. 그 결과 만들어진 바이러스는 각 부모 바이러스에서 물려받은 DNA 구간을 함께 포함할 수 있다. 마치 기존 문서 두 개의 일부를 이어 붙여 새 문서를 만드는 것과 비슷하다.

폭스바이러스는 이중가닥 DNA로 이뤄진 큰 유전체를 가지며, 유전 물질 교환은 이들의 생물학적 특성 가운데 하나로 알려져 있다. 이번 사례에서 연구진은 클레이드 Ib와 관련된 구간과 클레이드 IIb와 관련된 구간이 번갈아 나타나는 것을 확인했다.

인도 연구에서는 하나의 유전체를 따라 두 부모 계통에서 비롯된 특징적인 돌연변이가 배열돼 있었다. 연구진은 각 구간을 기준 서열과도 비교했다. 구간에 따라 서로 다른 부모 계통과 가까운 관계를 보여 유전체가 모자이크 구조라는 점을 뒷받침했다.

유전적 비교 결과

인도 연구진은 임상 검체와 이 검체에서 배양한 바이러스 분리주 모두에서 유전체의 99% 이상을 확보했다. WHO는 인도와 영국의 재조합 바이러스 서열이 99.9% 넘게 유사하다고 보고했으며, 이는 두 바이러스가 진화적으로 같은 기원을 공유한다는 점을 뒷받침한다.

인도 연구는 부모 계통 중 하나에서 물려받은 연속적인 유전체 구간인 재조합 구간 34개와 재조합 계통과 관련된 돌연변이 21개를 기술했다. 연구 보고서는 영국 바이러스에도 재조합 구간이 34개 있다고 설명했지만, WHO의 비교에서는 인도 서열에 34개, 영국 서열에 28개가 확인됐고 그중 16개가 공통으로 나타났다.

연구진은 연관성을 살펴보기 위해 여러 방법을 사용했다. 전체 유전체 비교에서 두 재조합 바이러스는 부모 계통 사이에 함께 위치했다. 유전 네트워크 분석에서는 상자 모양의 패턴이 나타났다. 이는 교환된 DNA가 포함돼 하나의 가지를 뻗는 계통도로는 깔끔하게 표현하기 어려운 관계를 보여주는 방식이다.

따라서 가장 강한 연관성은 두 바이러스 자체 사이에 있다. 두 바이러스의 높은 유사성과 공통된 모자이크 구조는 어느 나라도 이를 확인하기 전에 서로 관련된 재조합 계통이 이미 전파되고 있었음을 뒷받침한다.

살아 있는 바이러스 배양이 중요한 이유

푸네 연구팀은 DNA 분석에 그치지 않았다. 연구진은 임상 검체를 바이러스학 실험실에서 흔히 사용하는 베로 CCL-81 세포에 접종했고, 실험실에서 두 번째 계대 배양을 한 지 3일째 되는 날 바이러스 복제와 관련된 세포 손상을 관찰했다. 같은 실험을 세 차례 반복해 일관된 결과를 얻었다.

살아 있는 바이러스를 분리한 것은 모자이크 형태의 유전자 서열이 실제로 복제할 수 있는 바이러스에 속한다는 점을 더 확실히 보여줬다. 연구팀은 임상 검체와 바이러스 분리주에서 얻은 서열을 패소플렉서스와 국제 뉴클레오타이드 서열 데이터베이스 협력체에 참여하는 데이터베이스 등 공개 유전 데이터베이스에 등록했다.

영국 연구진도 결과를 여러 차례 확인했다. 원래 검체, 같은 검체에서 새로 추출한 물질, 같은 시점에 채취한 별도 면봉 검체, 배양한 바이러스 분리주를 각각 서열 분석했다. 그 결과 바이러스 유전체 서열이 모두 동일하게 나타났다.

살아 있는 바이러스 분리주는 다음 단계 연구에 필요한 실험 재료를 제공한다. 바이러스가 얼마나 빠르게 증식하는지, 항바이러스제에 어떻게 반응하는지, 항체가 이를 어떻게 인식하는지 측정할 수 있다. 영국 당국은 재조합 바이러스의 생물학적 특성에 관한 연구를 계속하고 있다.

일반 검사의 분류 결과가 달랐던 이유

인도 바이러스는 처음에 클레이드 II로, 영국 바이러스는 클레이드 Ib로 분류됐다. 이후 두 바이러스 모두 유전체 서열 분석을 통해 서로 밀접한 재조합 변이로 확인됐다.

진단용 PCR 검사는 유전 물질에서 짧고 특정한 구간을 찾아낸다. 계통 구분 검사는 바이러스 집단을 구별하는 데 쓰이는 표지를 살펴본다. 재조합 바이러스가 유전체의 한 부분에는 클레이드 Ib 표지를, 다른 부분에는 클레이드 IIb의 유전 물질을 갖고 있다면, 검사가 어느 구간을 살펴보느냐에 따라 분류 결과가 달라질 수 있다.

이는 검사실에서 질병을 진단하는 일과 바이러스를 정확히 분류하는 일 사이에 차이가 있음을 보여준다. 두 환자 모두 엠폭스 확진을 받았지만, 더 정밀한 유전적 분류에는 추가 분석이 필요했다.

WHO는 계통 구분 PCR 검사만으로는 재조합 변이를 신뢰성 있게 식별하지 못할 수 있다고 밝혔다. 인도는 일반적인 오르토폭스바이러스 및 MPXV 검사를 한 뒤 계통을 구분하고, 양성 사례의 유전체 서열을 분석한다. 영국은 클레이드 Ib로 확인된 모든 검체와 클레이드 IIb로 확인된 일부 검체의 서열을 분석한다.

인도 연구진은 재조합이 의심되는 사례를 조사하는 절차를 제시했다. 예상 밖이거나 서로 엇갈리는 계통 판정 결과가 나오면 전체 유전체를 살펴봐야 한다. 이번 사례는 새로운 변이가 공동 데이터베이스에 등록됐을 때 기존 서열을 다시 검토하는 일이 중요하다는 점도 보여준다.

회복한 환자 두 명, 더 넓은 지역의 전파 신호

인도 환자는 입원 치료를 받았고 합병증 없이 회복해 9월 29일 검사에서 음성 판정을 받았다. 인도 내 밀접 접촉자는 없었다고 밝혔으며, 보건 당국도 2차 감염 사례를 확인하지 못했다.

영국 환자 역시 중증으로 악화하지 않았다. 소수의 접촉자를 추적했지만 엠폭스 임상 증상을 보인 사람은 없었다. 환자를 돌본 의료진은 완전한 개인보호장비를 착용했으며, 접촉자에게는 안내를 제공하고 백신 접종을 권고했으며 증상이 나타나는지 관찰했다.

WHO가 최소 4개국에서 전파가 이뤄졌다고 추정한 것은 두 환자가 확인된 국가와 이들의 여행 이력을 종합한 결과다. 이 변이의 기원, 감염 사례를 연결하는 경로, 전파력이나 중증도에 미치는 생물학적 영향은 아직 밝혀지지 않았다.

두 환자 모두 다른 클레이드에 의한 엠폭스에서도 나타날 수 있는 증상을 보였다. WHO는 공중보건 위험 평가를 변경하지 않았다. 새로운 파트너나 복수의 파트너가 있는 남성과 성관계를 하는 남성, 성노동자 또는 다수의 일회성 성 파트너가 있는 사람에게는 위험이 ‘중간’, 구체적인 위험 요인이 없는 일반 인구에는 ‘낮음’으로 평가했다.

위험군을 위한 의미

엠폭스는 주로 성 접촉을 포함한 밀접한 신체 접촉으로 전파되며, 오염된 물질을 통해서도 퍼질 수 있다. 증상으로는 발열, 림프절 부종, 피부 또는 점막 병변 등이 나타날 수 있다. 병변이 몇 개만 생기는 경우도 있어 초기에 알아채기 어려울 수 있다.

영국 보건안보청(UKHSA)의 성매개감염 담당 책임자 케이티 싱카는 유전체 검사가 바이러스 변화를 조기에 발견하는 수단이라고 강조했다. 엠폭스가 때로 중증 질환을 유발할 수 있다며 접종 대상자에게 백신을 맞을 것도 권고했다.

영국의 정기 예방접종 프로그램은 성 파트너가 여러 명인 사람과 집단 성행위에 참여하는 사람 등 노출 위험이 높은 접종 대상 집단을 겨냥한다. 접종 지침에 인용된 연구에서는 클레이드 II에 대한 예방 효과가 약 75~80%로 나타났으며, 클레이드 Ib에도 예방 효과가 있을 것으로 예상된다. 재조합 바이러스가 면역에 어떻게 반응하는지 확인하는 연구도 아직 필요한 실험실 조사에 포함된다.

2024년 10월 이후 클레이드 Ib 감염 사례가 런던, 이스트서식스, 리즈, 잉글랜드 북동부에서 확인됐으며, 일부 집단에서는 제한적인 가정 내 전파가 있었다. 클레이드 Ib 감염을 보고한 다른 국가로는 미국, 스페인, 이탈리아, 네덜란드, 포르투갈이 있다. 이 사례들은 확인된 재조합 감염 두 건과 함께 더 넓은 감시의 배경을 이룬다.

WHO는 위험군 백신 접종, 신속한 진단, 적절한 임상 진료, 감염 관리를 계속 권고하고 있다. 또한 HIV 및 성매개감염 진료와 엠폭스 서비스를 연계하고, 조기 HIV 검사와 필요한 경우 치료를 받을 수 있도록 권고한다.

WHO가 검사실에 권고하는 다음 조치

WHO는 유행 초기 단계에 모든 확진 사례의 검체를 서열 분석할 것을 권고한다. 지역사회 전파가 확립된 경우에는 확진 사례 중 최소 10%, 즉 10명 가운데 적어도 1명의 표본을 대표성 있게 선정해 서열 분석하도록 권고한다.

해외 유입 감염, 이례적이거나 중증인 사례, 관련 여행 이력이 있는 사례는 유전적 정밀 조사의 우선 대상이다. 서열을 신속히 공유하면 다른 지역 검사실도 새로운 결과를 비교하고 이전 분류를 재평가할 수 있다. 인도 검체도 이런 과정을 거쳤다.

WHO는 여행 관련 권고를 다음과 같이 직접 밝혔다.

WHO는 이 사안과 관련해 현재 이용할 수 있는 정보를 바탕으로, 이 보고서에 명시된 국가를 오가는 여행이나 해당 국가와의 교역에 제한을 두지 말 것을 권고한다.

테워드로스 아드하놈 거브러여수스 WHO 사무총장은 2025년 9월 5일 엠폭스가 더 이상 국제적 공중보건 비상사태가 아니라고 발표했다. 2026년 8월까지 연장된 상시 권고에 따라 감시와 대응 의무는 계속된다.

인도 사례는 이러한 의무가 왜 필요한지 구체적으로 보여준다. 임상 진료로 환자는 병을 이겨냈고, 일반 검사는 엠폭스를 확인했으며, 유전체 서열 분석으로 이례적인 유전체를 포착했다. 이어 국제 데이터베이스가 갱신되면서 변이를 정확히 분류하는 데 필요한 연결고리가 마련됐다.

핵심 내용

• 인도 환자는 2025년 9월 1일 증상이 나타나, Ib/IIb 재조합 변이의 가장 이른 감염 확인 사례가 됐다.
• 인도와 영국에서 확인된 바이러스 서열은 유사도가 99.9%를 넘어 진화적 기원을 공유한다는 점을 뒷받침한다.
• 두 환자 모두 중증으로 악화하지 않고 회복했으며, 접촉자 추적에서도 2차 감염 사례는 확인되지 않았다.
• 초기 계통 검사에서는 서로 다른 분류 결과가 나왔지만, 유전체 서열 분석으로 재조합 관계가 밝혀졌다.
• WHO는 해당 변이의 전파가 3개 지역에 걸친 최소 4개국에서 이뤄진 것으로 평가한다.
• WHO의 위험 평가는 바뀌지 않았으며, 지속적인 서열 분석과 위험군 백신 접종을 권고하고 여행 및 교역 제한은 권고하지 않는다.